在本學院的二級能量醫學裡，有提供中醫或西醫醫學課程，中醫基礎課程為時六個月，西醫基礎課程要為時十到十二個月，用專業療法的角度來看待靈氣療法，假如一般人都不接受專業醫護人員用直覺來治療病人的話，那麼為何有人會默許靈氣治療師運用直覺或想像力來治療病人？若每位同學都明白療法背後的理論和知識，他們才能提供有實際療效的療程。技術成熟者，更可以跟中西醫互相合作，這樣才算得上學好能量醫學。這也是同學需要長期學習能量醫學的主因。

在二級能量醫學課程，會訓練同學們開始療癒他人，從亞健康到一般家庭健康相關的問題。專科靈療仍不屬於二級能量醫學的應用範圍。二級諮商師和療癒師需要先證明自己能夠療癒一般家庭健康問題，穩定掌握這個範圍裡的靈療知識與技術，之後才能接案收費。當然學院也會在學生進行五十二場他療個案實習的時候，提供指導與諮商，並且經常替學生接案實習。如果沒有實習個案，學院就會用各種醫案來講解，幫助學習者累積經驗。每個月我們也有安排幾個研討課程，讓同學討論學習困難或進行遠距團練。二級能量醫學課程的內容非常豐富，以致大多學員都會要求延長學習時間完成學習。